我国煤炭的内河运输主要由长江和京杭运河承担。煤炭内河运输量虽然比海运量小，但也是煤炭水路运输的重要组成部分。内河下水港有长江通道中的四港（南京港、武汉港、芜湖港、枝城港）、京杭运河上的徐州港。其中南京港和芜湖港的发运量较大，两港的发运量占内河煤炭发运量的84%。

长江干流各港口下水的煤炭主要流向华东和华中地区，京杭运河下水的煤炭主要运往江浙一带。

长江通道

2010年，6万吨级货轮首次直航长江，开创了我国大型运煤船舶“江海联运”的历史。

大型船舶运煤能有效降低运输成本，提高效率。大型船舶与小型煤船相比物流成本优势相当明显。按目前国内南北航线煤炭运价进行计算，租用6万吨级船舶与租用2 万吨级船舶相比，电厂每年可节省煤炭运输费用千万元以上（按每年300万吨煤炭计算）。船舶在北方港口装运时，除取料和装船作业外，还有辅助作业时间，如，走靠船时间。船舶不管吨位有多大，走靠船时间一般都需要四个小时左右，耗时基本一样。小型船舶走靠频繁，花费时间过多，严重影响北方煤炭码头的作业效率。东南沿海、沿江地区一些电厂码头吨位偏小，只有1万—2万吨级，泊位和航道吃水浅、吨位偏小，小船在北方港口走靠船等辅助时间相对较长，是造成北方港口煤炭周转慢、易压港，北煤南运效率降低的一个重要原因。

京杭运河航道

京杭运河全长1747公里，贯通钱塘江、长江、淮河、黄河、海河五大水系，流经六省市，北连环渤海经济圈，南接长三角地区，将两个经济增长极一线相连，它的北端连接济宁、枣庄、徐州、商丘、淮北等煤炭基地，南端连接经济发达的长三角地区。一方面便利了煤炭外销，为产煤区的经济带来了活力；另一方面保证了长三角地区便捷的煤炭供应，保障这一地区日益增长的煤炭需求，为这一地区的经济发展注入了强大的动力。

京杭运河在我国北煤南运中具有以下优势：

第一，水运便捷发达。长三角地区的特点是水网密布，内河水运发达，江苏全省水域面积占总面积的17%，拥有内河航道总里程2.48万公里。此外，根据2006年8月交通部和江苏省政府联合批复的《江苏省干线航道网规划》，在2020年之前江苏将建成以长江、京杭运河为主轴，以三级及以上航道为主体，形成以京杭运河、连申线和淮河出海航道、通扬线、长江干线、芜申线等“两纵四横”3455公里高等级航道组成的干线航道网，预计静态总投资540亿元。

第二，大量运输优势。内河运输受气候制约小，可以实现全天候作业，加上近年来江苏加大了运河整治投资力度，运河江苏段全部实现了双闸，部分修建了三线船闸，通过能力大大提高，保证了货物运输的及时性。由于运河航道等级的提高，运河船队吨位也不断扩大。随着南水北调工程的建设，运河的航运条件将会大大改善，运量潜能也将不断被发掘。

第三，运输成本低，降低了企业采购成本。经过比较，对运河地区用煤工厂来说，内河运输成本比铁路直达要低35—40元/吨。对于一个年用煤量200万吨的工厂来说，仅仅对销售过程中的中转渠道进行调整和科学选择，每年就可以减少7000万元的生产成本。