在金融危机中本来就处于艰难时刻的对冲基金行业，因为麦道夫500亿美元的诈骗案而受到更大的沉重打击。

　　2008年的金融危机全面爆发使得对冲基金行业在这一年里经历了非常困难的时期，美林的一份报告显示，在2008年第四季度从对冲基金行业撤资就达1100亿美元，在2009年的第一季度估计将会是1000亿美元。对冲基金的持续大幅亏损造成的巨额赎回已经使得很多对冲基金不得不出卖资产来募集资金，而这股被迫出售的风潮又使得资产价格下降，给对冲基金造成了更多的损失。甚至于像行业中的翘楚比如Citadel Investment Group在去年损失了其一半的资产。

　　“在过去五个月里，对冲基金的经营模式处在一个不断的变化当中，”原路透集团金融研究机构理柏(Lippers)的美国高级分析师桑德森(Ferenc Sanderson)说，“而现在麦道夫案使得投资人对对冲基金行业的基本信心在丧失。”

　　麦道夫案不可能在一个更糟的时候来到。当各大金融机构、名人、专业的投资基金都成为麦道夫案的受害者时，投资者的信心前所未有地低落，这有可能需要对冲基金的管理者以后多年的经营才能重获信任。而即便日后从危机中恢复，对冲基金的市场规模也很有可能比2008年初将近2万亿美元要小很多。自从2008年开始，对冲基金的资产已经下降了25%。

　　“很多对冲基金的经营者并没有像他们许诺的那样将投资策略多样化，他们的投资策略都是极为相关的。”桑德森说，“一些基金的基金也没有像他们许诺的那样作尽职调查。这些都让投资者的信心丧失。”

　　在对冲基金前几年红火的时候，该行业标榜的是多样的战略和严格的风险管理会做到市场中性化，即基金回报与证券市场的波动无关，从而达到规避系统风险的可能。在次级抵押信贷危机爆发前，很多对冲基金的业绩几乎实现了这一目标。比如，根据对冲基金研究(Hedge Fund Research)的资料，在2000年，当标准普尔指数下降9%的时候，对冲基金反而上涨5%。

　　但是自2008年9月以来，金融危机的爆发使得股票市场产生了巨额跌宕，市场的巨大波动使得对冲基金也很难把握。而且SEC在很长一段时间都禁止卖空使得几乎所有类型的对冲基金都在亏钱。